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水溶肥常用的第一種施肥方式是土壤澆灌、沖施。通過土壤沖施或者灌溉的時候，先行混合在灌溉水中，這樣可以讓植物根部全面接觸到肥料，通過根的呼吸作用把化學營養元素運輸到植株的各個組織中，讓植物盡情的呼吸各種營養元素；
水溶肥常用的第二種施肥方式是滴灌、噴灌和無土栽培。在一些極度缺水地區、規模化種植的大農場以及在高品質高附加值經濟作物上，人們在灌溉的時候，將肥料溶解在水中，澆水的同時也是施肥的過程，即水肥一體化，不僅節約灌溉水，也提高勞動生產效率。
水溶肥常用的第三種施肥方式是葉面噴施。把水溶肥先行稀釋溶解于水中進行葉面噴施，或者與非堿性農藥一起溶于水中進行葉面噴施，通過葉面氣孔進入植株內部，極大地提高了肥料吸收利用效率。
